双端测序（Paired-end sequencing）是一种第二代测序技术，它通过读取DNA片段的上下游两个端点序列来提高测序的准确性和覆盖度。在双端测序中，DNA分子首先被切成两个不同长度的片段，然后这两个片段的末端分别被测序。通过比较这两个端点序列，研究人员可以推断出原始DNA分子的长度和方向。
以下是双端测序的一些关键特点：
1. 提高测序深度：双端测序可以提供更多的序列信息，从而提高测序深度，这对于基因组组装和变异检测非常有用。
2. 提高组装质量：由于双端测序提供了更多的序列信息，因此可以更准确地组装基因组，尤其是在复杂基因组中。
3. 变异检测：双端测序可以检测到较小的变异，如单核苷酸变异（SNVs）和插入/缺失变异（indels）。
4. 基因表达分析：双端测序可以用于基因表达分析，通过比较两个端点序列，可以确定基因的转录起始和终止位置。
5. 长读长测序：双端测序通常具有较长的读长，这有助于提高测序的准确性和覆盖度。
双端测序通常与Illumina、ABI SOLiD和Roche 454等第二代测序平台结合使用。这些平台可以同时读取两个端点序列，从而实现双端测序。
